Desde 1745 fue coadjutor de Girolamo Chiti, maestro de capilla de S. Giovanni in Laterano, en Roma y con él se perfeccionó en el estudio de la composición sacra.  A la muerte de Chiti, en 1759, lo sucedió como maestro de coro, cargo que ocupó ininterrumpidamente hasta su  jubilación en agosto de 1791. También fue miembro de la Congregación de Músicos de Santa Cecilia en Roma, donde ejerció como examinador [1] y en la que en los años 1752-3, 1760-1, 1771-2 y 1779-91 ocupó el cargo. de Guardián de la sección de maestros compositores. De 1761 a 1773 también fue maestro de coro en S. Maria in Vallicella.

A su muerte el puesto que ocupaba en San Giovanni fue ocupado por Pasquale Anfossi. Entre sus alumnos recordamos al compositor francés André-Ernest-Modeste Grétry que estudió con Casali durante dos años. Casali fue un músico culto, mucho más inclinado a la composición vocal sacra que a la profana, sensible a la influencia del estilo policoral que había tenido en Roma, en el siglo anterior, destacados representantes en Orazio Benevoli y Virgilio Mazzocchi y su escuela , e igualmente interesado por la gran tradición polifónica palestriniana, a la que asimiló profundamente, como atestiguan sus numerosas composiciones a cappella. Como Cannicciari, que murió en 1744 pero siguió siendo un ejemplo destacado durante mucho tiempo, Casali también trató de conciliar la sagrada tradición polifónica de la escuela romana con las nuevas orientaciones musicales en una síntesis personal, adoptando el estilo concertante y policoral e introduciendo el órgano y orquesta en las composiciones más exigentes. 

Edición discográfica con una obra de Giovanni Battista Casali

En numerosas de sus obras el la homofonía alterna con concertato y voces solistas, a menudo virtuosísticamente ricas en florituras, con episodios contrapuntísticos elaborados con gran habilidad. Muchas composiciones de C., que gozaron de una discreta notoriedad entre sus contemporáneos, pasaron a formar parte de la célebre biblioteca de música sacra del abad Fortunato Santini. Entre esas vocales recordamos la “Beatus vir” y los tres “Dixit a 4 voces”, el “Dixit a 9 voces”, los dos “Confitebor para soprano, contralto y coro”, las cuatro misas a 4 voces, la “Lauda Ierusalem a 8 voces”, el “Confitebor a 4 voces concertadas”; entre los de voces e instrumentos el “Credo a 4 voces con violín , violas obligadas, oboe, trompeta, trompas ad limitum”, el “Veni Creator a 4 voces con violín, violas, oboe, trompa y órgano”, el motete “Fuge o misera colomba”, una yo canto solo con violin, los salmos: “Dixit Dominus a 4 voces” con violín, oboe, trompeta, trompa y bajo, e “In virtute tua”, a 4 voces con violonchelo, las cuatro letanías a 4 voces con orquesta y órgano. De Casali hay que recordar también los numerosos oferentes y escritos graduales para todas las festividades del año litúrgico, a 2, 3 ó 4 voces y órgano.

Casali también compuso numerosos melodramas y oratorios, en los que su escritura musical tiende a hacerse simple y chata, rica en melodías cantabiles y ritmos característicos o populares y desprovista de refinamientos armónicos. En el contexto de la música dramática, el estilo poco original e imaginativo no permitió a Casali emerger en la pléyade de compositores menores de la época con alguna obra particularmente feliz. Casali fue también un maestro apreciado y conocido, pero inclinado a potenciar en sus alumnos más los conocimientos escolásticos de armonía, contrapunto y formas musicales tradicionales que la imaginación y la libertad inventiva. En los años en que ocupó el cargo de tutor de la sección de maestros compositores en la Congregación de Músicos de S. Cecilia, Casali fue un examinador exigente y severo de los aspirantes a académicos, incluido Quagliati, y desempeñó un papel destacado en el contexto de la cultura musical romana.